инженер по ОТ по сути - контролёр. И от того как он контролирует, зависит и ответственность. Пишите предписания буквально на все нарушения, этим вы себя застрахуете. Любой проверяющий обязательно найдет какое либо нарушение. А вы ему своё предписание - я видел, отреагировал, предписал и т.п., а то что оно не исполнено, это уже вопрос не к Вам. И обязательно доводите свои предписания до руководства, желательно с их визой. Тогда, я думаю у Вас проблем не возникнет.