Из личного опыта. Для Госинспекции Ваше особое мнение ничего не значит... Но! Оно вполне может пригодиться, если материалы расследования несчастного случая будут переданы, скажем в Следственный комитет или суд. Там все зависит от следователя. В моем случае (попался порядочный "следак", повезло с ним) он изучал как материалы расследования, так и наше особое мнение, которое в дальнейшем повлияло на его решение. А в суде по этому поводу целый "консилиум" ))) был.
Так что если не согласны с Госинспекцией, пишите особое мнение однозначно!